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  1. 基础实验

琼脂糖凝胶DNA回收

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Last updated 1 year ago

准备事项 ·在BufferDW2中,加入4倍体积的无水乙醇,并于室温保存。 ·小型高速离心机(~12,000×g) ·水浴锅温度设至50~55℃

实验步骤: 1、配制合适浓度的琼脂糖凝胶,电泳分离DNA片段。当DNA片段分离后,把凝胶放置于紫外灯下,快速切下含目的DNA片段的凝胶,并尽量去除多余的凝胶。 2、称取凝胶块的重量,并转移至1.5或2.0ml离心管中。按100mg凝胶块相当100μL体积计算,加入1~3倍体积Buffer GDP。50~55℃水浴10~15分钟,让凝胶块完全溶解。水浴期间,颠倒混匀3次加速溶胶。 若凝胶块重量为200mg,则加入200~600μL Buffer GDP。 凝胶浓度超过2.0%时,加入2~3倍体积的Buffer GDP。 处理超过5KB的片段,加3倍体积(凝胶体积)溶胶后,再加入1倍体积(凝胶体积)异丙醇混匀后再按第三步进行操作。 3、短暂离心收集管壁上的液滴。将 HiPure DNA Mini Column 套在2ml离心管中。把≤700μL溶胶液转移至柱子中。12,000×g离心30~60秒。 4、(可选:溶胶液超过700μL)倒弃滤液,把柱子套回2ml离心管中。把剩余的溶胶液转移至柱子中。12,000×g离心30~60秒。 5、倒弃滤液,把柱子套回2ml离心管中。加入300μL Buffer GDP至柱子中。静置1分钟。12,000×g离心30~60秒。 6、倒弃滤液,把柱子套回2ml离心管中。加入600μL Buffer DW2(已用无水乙醇稀释)至柱子中。12,000×g离心30~60秒。 7、倒弃滤液,把柱子套回2ml离心管中。加入300μL Buffer DW2(已用无水乙醇稀释)至柱子中。12,000×g离心2分钟。 取出柱子时,不要让柱子底部接触到液体,若碰到了液体,倒弃液体后再离心1分钟。对某些敏感应用(需将大部分洗脱液加入连接反应液时):打开柱子的盖子,空气干燥5分钟以彻底去除乙醇。 8、把柱子套在1.5ml离心管中,加入15~30μL Elution Bufer至柱子膜中央。放置2分钟。12,000×g离心1分钟。丢去柱子,把DNA保存于-20℃。 若需要获得最高产量,建议重复第9步(这里确实是9,俺也不知道这个第9步是哪里来的)进行第二步洗脱。回收大于3KB以上的片段时,最好把Elution Buffer预热至55℃。

改进版实验步骤: 1、配制合适浓度的琼脂糖凝胶,电泳分离DNA片段。当DNA片段分离后,把凝胶放置于紫外灯下,快速切下含目的DNA片段的凝胶,并尽量去除多余的凝胶。 2、称取凝胶块的重量,并转移至1.5或2.0ml离心管中。加入500μL的Buffer GDP。55℃水浴10~15分钟,让凝胶块完全溶解。水浴期间,颠倒混匀3次加速溶胶。 3、短暂离心收集管壁上的液滴。将 HiPure DNA Mini Column 套在2ml离心管中。把500μL溶胶液转移至柱子中。13,000 RPM 瞬离(离心机转速到达13,000 RPM 后即可立即按stop键,实际时间大约0-3秒)。 4、(可选:溶胶液超过700μL)倒弃滤液,把柱子套回2ml离心管中。把剩余的溶胶液转移至柱子中。13,000 RPM 瞬离。(如果需要提高产量,则保留该步骤) 5、倒弃滤液,把柱子套回2ml离心管中。加入300μL Buffer GDP至柱子中。静置1分钟。13,000 RPM 瞬离。 6、倒弃滤液,把柱子套回2ml离心管中。加入600μL Buffer DW2(已用无水乙醇稀释)至柱子中。13,000 RPM 瞬离。 7、倒弃滤液,把柱子套回2ml离心管中。加入300μL Buffer DW2(已用无水乙醇稀释)至柱子中。13,000 RPM 离心2分钟。 取出柱子时,不要让柱子底部接触到液体,若碰到了液体,倒弃液体后再离心1分钟。对某些敏感应用(需将大部分洗脱液加入连接反应液时):打开柱子的盖子,空气干燥5分钟以彻底去除乙醇。 8、把柱子套在1.5ml离心管中,加入15~30μL ddH2O(双蒸水)至柱子膜中央。于55℃水浴锅中放置2分钟(可延长到5min)。13,000 RPM 离心1分钟(可延长到2min,以提高产量)。丢去柱子,把DNA保存于-20℃。

参考源:

[1]美基生物的说明书

琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒HiPure Gel Pure DNA Mini Kit (D2111)